Reakcija lančanog umnožavanja, odnosno PCR (polimerase chain reaction) jeste metoda kojom se unapred određena DNK sekvenca umnožava veliki broj puta za relativno kratko vreme. Ovom metodom je prevaziđen problem količine DNK, jer je dovoljna mala količina uzorka (0,5–50 ng). PCR metoda je zamenila metodu kloniranja DNK uz pomoć bakterijskog plazmida, iako se pomenuto kloniranje i dalje koristi za velike fragmente koji se PCR metodom ne mogu umnožiti. Za otkriće ove metode 1983. godine zaslužan je američki naučnik Kari Banks, koji je upravo zbog otkrića ove metode dobio Nobelovu nagradu 1993. godine. Na značaj ovog otkrića upućuju brojne primene ove metode. PCR metoda je našla primenu u: forenzičkoj analizi DNK uzoraka, DNK analizi fosilnih ostataka, detekciji patogena, dijagnostici naslednih bolesti, utvrđivanju očinstva, prehrambenoj industriji itd. U botaničkim naukama PCR metoda je našla primenu u detekciji i identifikaciji biljnih patogena, što je doprinelo borbi protiv biljnih bolesti. Ovo je izuzetno značajno u prehrambenoj industriji, kao i sa ekonomskog stanovišta, s obzirom da biljni patogeni utiču na ukupan prinos. Takođe, u prehrambenoj industriji, za analizu prehrambenih proizvoda koriste se PCR metode za detekciju i kvantifikaciju genetičkih modifikacija, jer njihovo postojanje u velikoj meri može biti nepogodno u ishrani. PCR metoda je našla primenu i u identifikaciji i sistematici biljaka. Kada morfološki karakteri nedostaju, jer na primer na osnovu fecesa herbivora želimo da zaključimo čime se ta životinja hrani, molekularne metode mogu pomoći.

Ovaj rad će se fokusirati na pojašnjenje tih metoda, njihovih biohemijskih osnova i na opis značaja molekularnih metoda koje se primenjuju kada su u pitanju botanička istraživanja.